ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ ГЕНОМОВ МЫШЕВИДНЫХ ГРЫЗУНОВ В БАЗАХ ДАННЫХ И ИХ КАРТИРОВАНИЕ
Д.И. Остромышенский,1 И.С. Кузнецова,1 А.С. Комиссаров,1
И.В. Картавцева,2 О.И. Подгорная 1
1Институт цитологии РАН, Санкт-Петербург, и 2 Биолого-почвенный институт
ДВО РАН, Владивосток;
электронный адрес: necroforus@gmail.com
Тандемно-повторяющиеся последовательности представляют собой уникальный для эукариот
класс ДНК. Их содержание в геноме у высших эукариот может достигать десятков процентов. Однако
вопросы эволюции этого класса последовательностей остаются малоисследованными. Ранее методами
биоинформатики выявлены 62 семейства тандемных повторов (ТП) Mus musculus; в настоящей работе 7
из них картировано на метафазных пластинах с помощью флуоресцентной гибридизации in situ (FISH).
Те же пробы использовали для двух других видов рода Mus — M. caroli и M. spicilegus. Показано, что
наборы ТП совпадают только у близкородственных видов мышей. Но даже у таких видов наблюдаются
различия в локализации на хромосомах и интенсивности метки отдельных ТП. Только отдельные семейства
ТП остаются общими при увеличении эволюционного расстояния между видами. Применение сочетания
биоинформатических и молекулярно-биологических методов для исследования эволюции ТП
перспективно, но пока ограничено наличием прочитанных геномов близких видов.
Ключевые слова:
тандемные повторы, сателлитные ДНК, грызуны Mus
| Full text
| Back
| Contents
| Main |
|
