БОЛЬШИЕ ТАНДЕМНЫЕ ПОВТОРЫ СИРИЙСКОГО ХОМЯЧКА MESOCRICETUS AURATUS IN SILICO И IN SITU
Д.Ю. Михеев,1 О.И. Подгорная,2 Д.И. Остромышенский 2,*
1 С.-Петербургский научно-исследовательский институт лесного хозяйства, и
2 Институт цитологии РАН, Санкт-Петербург;
* электронный адрес: necroforus@gmail.com
Тандемно-повторяющиеся последовательности представляют собой уникальный для эукариот
класс ДНК и составляют до нескольких десятков процентов от генома у высших эукариот. Классические
методы поиска тандемных повторов, несмотря на более чем полувековую историю исследований,
не смогли выявить полный набор тандемных повторов ни для одного позвоночного животного. Ранее
была показана возможность поиска тандемных повторов в хорошо собранном геноме домовой мыши с
помощью методов биоинформатики. В настоящей работе предпринята попытка поиска тандемных повторов
в относительно плохо собранном геноме сирийского хомячка. In silico найдено 19 семейств больших
тандемных повторов в геноме этого вида, причем только 1 семейство было ранее клонировано и
идентифицировано как тандемный повтор. Для 4 семейств, предсказанных in silico тандемных повторов,
с помощью гибридизации in situ показана локализация в области первичной перетяжки хромосом.
Ключевые слова:
сателлитная ДНК, тандемные повторы, сирийский хомячок
| Full text
| Back
| Contents
| Main |
