КЛАССИФИКАТОР АВТОМАТИЧЕСКОГО РАСПОЗНАВАНИЯ ХРОМОСОМ
СВИНЬИ ДОМАШНЕЙ (SUS SCROFA DOMESTICUS)
В.Н. Стефанова,1,* М.Н. Зенина 2
1 Институт цитологии РАН и 2 Институт гематологии и трансфузиологии, Санкт-Петербург;
* электронный адрес: vestefan@mail.ru
Необходимость проведения цитогенетического мониторинга в свиноводстве и выбраковки животных
с хромосомными аберрациями из селекционного процесса ставит задачу автоматизации кариотипирования
с помощью специального программного обеспечения, аналогичного существующему для хромосом
человека. В настоящей работе разработан автоматический классификатор хромосом свиньи на
базе программного обеспечения "Карио-3.1". Первоначально в состав классификатора были включены
1578 хромосом из 47 метафазных пластинок. Проверка работы классификатора показала, что частота
ошибочного распознавания хромосом составляет 8.2 %, или 3.12 ± 0.26 ошибки на метафазу. Дополнение
классификатора до 1807 хромосом позволило снизить частоту ошибки до 6.1 %, или 2.78 ± 0.18
ошибки на метафазу. Апробация классификатора на хряке с реципрокной транслокацией rcp(1p–;11p+)
продемонстрировала корректную классификацию всех хромосом в наборе. Сфера применения классификатора
хромосом свиньи обсуждается.
Ключевые слова: хромосомы свиньи, кариотипирование, автоматическая классификация, программное
обеспечение "Карио-3.1"
| Full text
| Back
| Contents
| Main |
