РЕТРОТРАНСПОЗОН КЛАССА LINE ЯВЛЯЕТСЯ КОМПОНЕНТОМ ПАТТЕРНА ПОЛИМОРФНЫХ ФРАГМЕНТОВ ПАРТЕНИТ ТРЕМАТОДЫ HIMASTHLA ELONGATA
А.И. Соловьева,1,2 Н.К. Галактионов,1 О.И. Подгорная 1,2
1 Кафедра цитологии и гистологии С.-Петербургского государственного университета и
2 Институт цитологии РАН, Санкт-Петербург;
электронный адрес: orcinuca@gmail.com
Мы определили, что метод S-SAP (sequence specific amplification polymorphism) выявляет клональ-ную изменчивость партеногенетических личинок червя
Himasthla elongata (Trematoda, Echinostomatidae), ранее считавшихся генетически однородными. Провели клонирование и секвенирование консервативного продукта
длиной ~500 п. н. Клонированный фрагмент обозначили как В1 по зоне агарозного электрофореза, из которого он клонирован. Анализ последовательности B1 показал, что
фрагмент имеет максимальное сходство с элементами класса LINE CR1-семейства воробья и гидры. Гибридизация in situ (FISH) выявляет диспергированное распределение B1.
Остальные фрагменты, клонированные из той же зоны, соответствуют, как и B1, консервативной области обратной транскриптазы (RT) элементов семейства CR1. Таким образом,
показано: 1) церкарии трематоды H. elongata обладают клональной изменчивостью; 2) метод S-SAP позволяет получить паттерн распределения фрагментов, характеризующий
отдельныx церкарий; 3) консервативный район RT вносит свой вклад в образование паттерна полиморфных фрагментов при выявлении клональной изменчивости партенит
H. elongata методом S-SAP. В дальнейшей работе предполагается определить наличие транскриптов CR1 в церкариях H. elongata и определить состав вариабельных
фрагментов паттерна клональной изменчивости.
Ключевые слова: LINE, CR1, S-SAP, клональная изменчивость, плоские черви
| Full text
| Back
| Contents
| Main |
