Цитология  2013  55 (4) : 230–233
ОРГАНИЗАЦИЯ И ЭВОЛЮЦИЯ СУБТЕЛОМЕРНЫХ РАЙОНОВ ХРОМОСОМ РЖИ

Е.В. Евтушенко,1 Е.А. Елисафенко,2 А.В. Вершинин 1,*

1Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН и 2 Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск;
* электронный адрес: avershin@mcb.nsc.ru

Субтеломерные районы хромосом относятся к наиболее пластичным и быстро эволюционирующим районам эукариотических геномов. Отличительной чертой хромосом ржи (Secale) является наличие крупных блоков субтеломерного гетерохроматина на плечах всех 7 пар хромосом. Различия между размером генома культивируемой ржи Secale cereale и древним видом Secale silvestre достигают 15 %, и основный вклад в эти различия вносит увеличение размеров субтеломерных гетерохроматиновых районов. Ранее было показано, что субтеломерный гетерохроматин ржи насыщен множеством копий нескольких семейств тандемно организованных последовательностей ДНК, образующих длинные тяжи мономеров. В настоящей работе мы изучали тонкую молекулярную организацию и взаимное расположение семейств тандемных повторов и окружающей их геномной, не тандемной. Рестрикционный анализ BAC-клонов, содержащих ДНК короткого плеча первой хромосомы ржи, 1RS, показал, что в тяжах основная масса мономеров организована специфическим образом в структуры более высокого порядка - от димеров до пентамеров и даже гексамеров, которые образуются в центральных участках тяжей. Окружающая тяжи тандемных мономеров геномная ДНК представлена копиями семейств различных классов ретротранспозонов, присутствующих также в геномах пшеницы и ячменя. Таким образом, специфическим молекулярным процессом, происходившим при формировании субтеломерного гетерохроматина в процессе дивергенции генома ржи от общего предка злаков, следует рассматривать взрывную амплификацию мономеров семейств тандемных повторов pSc200 и pSc250, приведшую к образованию длинных многочисленных тяжей среди массы различных копий ретротранспозонов. Логично предполагать, что последствием этого процесса стало увеличение размеров субтеломерного гетерохроматина и генома культурной ржи, Secale cereale.

Ключевые слова:  тандемно повторяющиеся последовательности ДНК, ВАС библиотека, ретротранспозоны, субтеломерный гетерохроматин, молекулярная организация и эволюция


|  Full text  |  Back  |  Contents  |  Main  |