ХАРАКТЕРИСТИКА ВНЕКЛЕТОЧНЫХ ПРОТЕАСОМ И АССОЦИИРОВАННЫХ С НИМИ БЕЛКОВ МЕТОДОМ iTRAQ-МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ
Ю.Я. Зайкова,1,2 В.А. Куличкова,1 Ю.Б. Ермолаева,1 А. Боттрилл,3
Н.А. Барлев,1,3,4 А.С. Цимоха,1,*
1 Институт цитологии РАН, Санкт-Петербург; 2 Санкт-Петербургский государственный политехнический университет;
3 Университет г. Лестер, Великобритания; 4 Санкт-Петербургский государственный технологический институт;
*электронный адрес: atsimokha@mail.cytspb.rssi.ru
Проведен iTRAQ-масс-спектрометрический анализ внеклеточных протеасом и выявлены посттрансляционные модификации (ПТМ) субъединиц внеклеточных
26S протеасом. Выявлены новые сайты убиквитинилирования и ацетилирования протеасомных субъединиц α2 (K196), α4 (K189 и K234), α6 (K217)
и Rpn6 (A2). Обнаружено, что в составе внеклеточных протеасом присутствует стандартный набор из субъединиц 26S протеасомы, а также PA200 регулятор, который,
как полагали ранее, локализуется лишь в ядре клеток. Получен первичный скрининг белков, взаимодействующих с внеклеточными протеасомами. Показано, что с
протеасомами ассоциированы белки, участвующие в таких основных клеточных процессах, как транскрипция, репарация ДНК, трансляция, а также белки цитоскелета
и убиквитин-протеасомной системы (УПС). Методом иммуноблотинга подтвердили взаимодействие протеасом с девятью белками, выбранными из полученного
белкового скрининга случайным образом.
Ключевые слова: внеклеточные протеасомы, iTRAQ-масс-спектрометрия, посттрансляционные модификации, убиквитинилирование
| Full text
| Back
| Contents
| Main |
|
