ОПЫТ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ТЕХНОЛОГИИ FTA® ДЛЯ СБОРА, АРХИВИРОВАНИЯ И МОЛЕКУЛЯРНОГО АНАЛИЗА ДНК МИКРОСПОРИДИЙ ИЗ КЛИНИЧЕСКИХ ОБРАЗЦОВ
О.И. Соколова, 1,2 А.В. Демьянов,3 Л.С. Боверс,4 Е.С. Дидье,4 Ю.Я. Соколова 4,5
1 Санкт-Петербургский государственный университет, 2 Клиническая инфекционная больница им. С.П. Боткина,
3 Научно-исследовательский институт особо чистых биопрепаратов, Санкт-Петербург, Россия, 4 Национальный центр по изучению приматов при
Тюлейнском университете, Новый Орлеан - Ковингтон, Луизиана, США и 5 Институт цитологии РАН, Санкт-Петербург, Россия;
5 электронный адрес: yysokolova@gmail.com
Технология FTA® впервые была испытана для сбора, архивирования и молекулярного анализа ДНК, содержащейся в образцах стула с целью выявления и идентификации
микроспоридий - внутриклеточных оппортунистических паразитов, вызывающих поражение кишечника и синдром мальабсорбции у людей с ослабленной иммунной системой,
в частности, у больных СПИДом. ДНК микроспоридий была успешно амплифицирована в 6 из 50 образцов стула ВИЧ-инфицированных пациентов Клинической инфекционной
больницы им. С.П. Боткина (Санкт-Петербург). Образцы наносили на специально обработанную фильтровальную бумагу (FTA-Cards, Whatman Inc. Florham Park, NJ, USA).
Ампликоны (фрагменты гена рибосомной РНК) были прочитаны прямым секвенированием. Виды микроспоридий - Encephalitozoon intestinalis, E. cuniculi, E. hellem и
Enterocytozoon bieneusi - идентифицированы по данным Банка генов с помощью программы NCBI BLAST. Данный метод иммобилизации ДНК на фильтровальной бумаге
особенно перспективен для эпидемиологических и популяционно-полевых исследований, требующих генотипирования видов и изолятов микроспоридий.
Ключевые слова: FTA®-технология выделения ДНК, микроспоридии человека, оппортунистические протисты, ПЦР
| Back
| Contents
| Main |
|
