2009. Том 51, № 3, c. 204-211
ПАРАДОКСЫ ОРГАНИЗАЦИИ ЦЕНТРОМЕРА И ГЕТЕРОХРОМАТИНА

О. И. Подгорная, Д. И. Остромышенский, И. С. Кузнецова, И. В. Матвеев, А. С. Комиссаров

Институт цитологии РАН, Санкт-Петербург;
электронный адрес: aleksey.komissarov@gmail.com

Центромер (CEN) - это структура, обеспечивающая удержание хроматид, правильность выстраивания хромосом в метафазной пластинке и прикрепления к веретену. Известно, что у млекопитающих ДНК CEN относится к группе сателлитных ДНК (сатДНК) - тандемно организованных высокоповторяющихся последовательностей. Растет количество свидетельств того, что CEN- и пери-CEN-хроматин необходимы для нормального CEN. CEN и прителомерные районы остаются "белыми пятнами" на картах хромосом, появившихся в результате чтения геномов. "Библиотечная" гипотеза предполагает, что в гетерохроматине каждого вида (рода) есть фрагменты разных сатДНК, но при фиксации вида происходит избирательное размножение фрагментов, что обеспечивает видоспецифичность сатДНК. Анализ базы данных Chromosome Unknown (ChrUn) привел к предсказанию in silico новых классов тандемных повторов мыши. Классы семейств тандемных повторов характерны не только для генома мыши, но и для генома крысы, так же как сходно распределение повторов по содержанию GC. Выявление общих структурных особенностей фрагментов CEN и пери-CEN ДНК позволит разрешить парадокс, заключающийся в том, что наборы белков, специфичных для CEN-района, связываются с абсолютно, казалось бы, несходными последовательностями.

Ключевые слова:  гетерохроматин, центромер, перицентромер, сателлитная ДНК, базы данных, геном, Chromosome Unknown, кривизна ДНК


Back    Contents    Main