КОНФОРМАЦИЯ ПЕТЛИ V3 БЕЛКА GP 120 HIV-1. СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ВИРУСНОГО ШТАММА HIV-HAITI
А. М. Андрианов
Институт биоорганической химии НАН Республики Беларусь, Минск;
электронный адрес: andrianov@iboch.bas-net.by
С использованием данных спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР) методами математического моделирования
построена структурная модель, описывающая конформационные свойства петли V3 белка gp 120 вируса иммунодефицита
человека типа 1 (HIV-1) в геометрическом пространстве углов внутреннего вращения. Определены элементы вторичной
структуры и конформации нерегулярных участков фрагмента, образующего основную антигенную детерминанту вируса, а также
детерминанты клеточного тропизма и образования синцития. На основе совместного анализа полученных результатов с
данными более ранних исследований идентифицированы структурно консервативные аминокислоты петли V3 - перспективные
"мишени" для создания противовирусных препаратов методами белковой инженерии. В частности, показано, что в списке
конформационно жестких остатков присутствует Asp-25, определяющий взаимодействие вируса с первичным рецептором CD4
клеточной мембраны, и Arg-З, играющий ключевую роль при его связывании с корецептором CCR-5 и с синдеканами -
протеогликанами гепарансульфата. Результаты работы обсуждаются с учетом данных литературы о биологической активности
индивидуальных аминокислотных остатков петли V3 белка gp 120 HIV-1.
Ключевые слова: вирус иммунодефицита человека типа 1, белок gp 120, петля V3, конформация,
компьютерное моделирование, спектроскопия ЯМР
Back
Contents
Main
