ИММУНОЦИТОХИМИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ СТАТУСА МЕТИЛИРОВАНИЯ МЕТАФАЗНЫХ ХРОМОСОМ ЧЕЛОВЕКА
А. А. Пендина,1 О. А. Ефимова,2 А. Н. Каминская,2 Т. В. Кузнецова,1
В. С. Баранов 1
1 Научно-исследовательский институт акушерства и гинекологии им. Д. О. Отта РАМН, Санкт-Петербург, и
2 Кафедра генетики и селекции С.-Петербургского государственного университета, Санкт-Петербург, Россия;
электронный адрес: pendina@mail.ru
Охарактеризовано распределение 5-метилцитозинобогащенной ДНК на метафазных хромосомах из ФГА-стимулированных лимфоцитов человека.
Иммуноцитохимическую детекцию 5-метилцитозина проводили с помощью моноклональных антител. Выявлено неравномерное распределение флуоресцентных
сигналов по длине каждой хромосомы кариотипа с преимущественной локализацией в большинстве R-, всех Т-сегментах, в районах прицентромерного гетерохроматина
и коротких плечах акроцентрических хромосом. Сегментспецифичность распределения флуоресцентных сигналов позволила описать новый тип сегментации метафазных
хромосом человека, условно названной нами М-сегментацией. Типичная локализация на хромосомах и различия в интенсивности флуоресценции дали возможность
идентифицировать М-маркеры, или так называемые лэндмарки, для каждой пары хромосом. Проведен анализ статуса метилирования М-сегментов с учетом имеющихся
в литературе данных об особенностях их нуклеотидного состава, а именно содержания GC-богатого изохора НЗ и плотности CpG-островков. Показано, что большинству
GC-обогащенных участков хромосом свойствен высокий уровень метилирования. В то же время для отдельных GC-богатых сегментов хромосом 6, 9, 10, 13 и 15 (6ql5,
6q21, 6q23, 9pl3, 9q22,9q32,10q24, 13q22,15ql5 и 15q24) характерно гипометилированное состояние, возможно, свидетельствующее об их особом функциональном статусе
в исследуемом типе клеток.
Ключевые слова: метилирование ДНК, 5-метилцитозин, метафазные хромосомы человека, GC-обогащенность, гетерохроматин
|
