ЗАВИСИМОСТЬ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА gag ВИРУСА ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА ОТ СООТНОШЕНИЯ
ЕСТЕСТВЕННЫХ И ОПТИМИЗИРОВАННЫХ КОДОНОВ
А. Кофман, М. Граф, А. Боджак, Л. Демл, К. Байлер, А. Харазова, Г. Вольф, Р. Вагнер
Институт медицинской микробиологии и гигиены, Университет Регенсбурга, Германия;
электронный адрес: akofman@tulane.edu
Вырожденность генетического кода предполагает кодирование одних и тех же аминокислот различными триплетами
нуклеотидов, однако среди различных организмов существует тенденция к преимущественному использованию тех или иных
кодонов, названных оптимальными, поскольку их присутствие ассоциируется с максимальной экспрессией гена. Содержание
аденина в геноме вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) существенно выше, чем в человеческих генах, что, как
предполагается, служит причиной сравнительно низкой экспрессии gag/pol и env генов ВИЧ в клетках
млекопитающих. Согласно другой точке зрения, низкий уровень экспрессии структурных белков ВИЧ объясняется
присутствием в кодирующих участках генов так называемых ингибиторных последовательностей. Нами исследована
экспрессия химерных иРНК белка gag ВИЧ, в которых последовательности дикого типа были частично заменены
"гуманизированными" синтетическими последовательностями, состоящими из кодонов, наиболее характерных для клеток
млекопитающих. Обнаружено, что присутствие гуманизированных последовательностей восстанавливает экспрессию
gag, которая находится в количественной зависимости от соотношения присутствующих в иРНК оптимизированных и
"диких" кодонов. Полученные результаты поддерживают концепцию о том, что низкий уровень экспрессии структурных
генов ВИЧ в клетках млекопитающих связан с расхождением в селективности использования генетического кода.
Back
Contents
Main
|
